Η ανασκαφή στην πλατεία Αγίας Αικατερίνης αποτελεί την κεντρική ανασκαφή στο λόφο Καστέλλι. Η έρευνα έφερε στο φως ολόκληρη την κάτοψη ενός κτηρίου και τμήματα τριών άλλων, μαζί με δρόμους και ανοιχτούς δημόσιους χώρους – πλατείες, τα οποία χρονολογούνται τη νεοανακτορική περίοδο ( 1700-1450 π.Χ.).
Το κτήριο το οποίο αποκαλύφθηκε ολόκληρο ονομάστηκε Οικία Ι, είχε δεύτερο όροφο και 14 δωμάτια στο ισόγειο. Διέθετε κεντρική είσοδο, προθάλαμο (Η), χώρους υποδοχής, μία πολύθυρη αίθουσα, κλιμακοστάσιο (Ο), μαγειρείο (Μ), αποθήκες και θησαυροφυλάκειο (D). Από τα ευρήματα ξεχωρίζουν υφαντικά βάρη (αγνύθες), αποθηκευτικά αγγεία, αγγείο που περιείχε καμένα όσπρια, πήλινες πινακίδες της μινωικής Γραμμικής Α΄ γραφής, σφραγίδες και κοσμήματα.
Η εγκατάσταση καταστράφηκε από πυρκαγιά γύρω στο 1450 π.Χ.. Εδώ βρέθηκε και το περίφημο «Σφράγισμα του Δεσπότη» το σπουδαιότερο από τα ευρήματα των ανασκαφών της Κυδωνίας.